一个女孩在亚马逊最深的丛林科洛尼亚出生并长大，科洛尼亚依靠亚马逊最强大的母亲精神“海龟妈妈”的支持。有一天，她发现她的祖国正受到威胁，并意识到除了她的人民，世界上还有其他人类。当她努力拯救她的天堂，反对对儿童的贪婪和剥削，伐木和非法采矿，她开始努力扭转这种毁灭和即将到来的邪恶的尤库鲁纳，生活在亚马逊河的黑暗。在母亲的精神指引下，安波决心拯救她的土地和人民，以免为时已晚。

阿蓝（Jesse Eisenberg 配音）是一只世界上极其稀少的蓝色金刚鹦鹉，当他还是雏鸟时，便被可鄙的偷猎者从里约的热带丛林中掳到美国。阴差阳错，他变成了小女孩琳达的宠物，从此相伴多年，如今的阿蓝俨然一个养尊处优的宅男，甚至到忘记了如何飞行。某天，名叫图里奥（Rodrigo Santoro 配音）的鸟类学家经过琳达（Leslie Mann 配音）经营的书店，他被阿蓝所震惊，并希望能将阿蓝带回里约，与世上仅存的另外一只雌鸟繁衍后代。